No se si te entiendo bien pero si la idea es cambiar los colores a las dos colonias, no creo que obtengas claros resultados. En mi opinión deberías:
1º Ambas colonias deben estar en las condiciones mas parecidas, edad, nº, hormigueros iguales, tipo de alimentos, periodicidad de la alimentación, cambios de agua simultáneos, humedad, ... intenta controlar todos los factores que sean posible. Mientras mas parecidas los resultados serán mas sólidos.
2º Establece un hormiguero como referencia, se suele llamar grupo "control" en el que mantengas siempre las mismas condiciones, es decir, siempre con el color rojo.
3º El otro hormiguero será el que sufra los cambios. Si vas a comprobar varios colores establece el mismo tiempo de influencia para todos los colores y entre unos y otros intercala el mismo tiempo con el rojo así los cambios serán iguales.
4º Piensa en que cosas te vas a fijar: actividad, apetito, se ven confiadas, agresivas, ....
5º Copara siempre la primera (control) con la segunda y no entre colores.
6º Comparte tus datos y conclusiones con esta tu casa

. De nada sirve hacer sin comentar.
Espero haberte ayudado. Por supuesto es como yo lo haría, no necesariamente cómo hacerlo.
Un saludo y suerte, me interesa mucho los resultados que puedas obtener.